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2013年3月12日 ;80 (11) 文章

罕见变异的全外显子组测序EIF4G1而且VPS35在帕金森病中

凯伦Nuytemans,Guney Bademci,凡妮莎Inchausti,艾米Dressen,丹尼尔·d·金纳蒙,Arpit梅塔,投入王,Stephan Zuchner,加里·w·比查姆,伊登·r·马丁,威廉·k·斯科特,杰弗里·m·万斯
第一次出版2013年2月13日 DOI: https://doi.org/10.1212/WNL.0b013e31828727d4
凯伦Nuytemans
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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Guney Bademci
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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凡妮莎Inchausti
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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艾米Dressen
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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丹尼尔·d·金纳蒙
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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Arpit梅塔
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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投入王
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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Stephan Zuchner
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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加里·w·比查姆
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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伊登·r·马丁
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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威廉·k·斯科特
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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杰弗里·m·万斯
来自约翰·p·赫斯曼人类基因组学研究所(k.n., g.b., v.i., a.d., d.d.k., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.)和莫里斯·k·尤德尔帕金森病卓越中心(k.n., g.b., v.i., a.d., a.m., l.w., s.z., g.w.b., e.r.m., w.k.s., J.M.V.),迈阿密大学米勒医学院,佛罗里达州。
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罕见变异的全外显子组测序EIF4G1而且VPS35在帕金森病中
凯伦Nuytemans,GuneyBademci,凡妮莎Inchausti,艾米Dressen,丹尼尔·D。Kinnamon,Arpit梅塔,投入王,斯蒂芬Zuchner,加里·W。比切姆,伊甸园R。马丁,威廉·K。斯科特,杰弗瑞米。万斯
半岛投注体育官网 2013年3月, 80 (11) 982 - 989; DOI:10.1212 / WNL.0b013e31828727d4

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摘要

摘要目的:最近,液泡蛋白分选35 (VPS35)和真核翻译起始因子4 γ 1 (EIF4G1)已被确定为2个导致帕金森病(PD)的基因。我们使用全外显子组测序对这两个基因的变异进行快速、并行分析。

方法:我们对213例PD患者和272例对照组进行了全外显子组测序。外显子组变异服务器数据库中频率<5%的罕见变异(rv)和我们自己的对照数据被考虑进行分析。我们使用RVASSOC和SKAT(序列核关联测试)以及单变量测试统计数据进行了联合基于基因的关联测试。

结果:我们发现了3本小说VPS35在3个案例中改变编码氨基酸的变异(非同义)。在多重家庭中有两种变异,都没有与PD分离。在EIF4G1我们鉴定了11个(9个非同义型和2个小型)rv,包括报道的致病突变p.R1205H,该突变分离于一个大家族的所有患病成员中,但也分离于1个未受影响的86岁家庭成员中。仅在隔离患者中发现了另外两例rv。而最初的关联研究表明,关联(p= 0.04),所有的房车EIF4G1随后在第二个数据集(p.F1461)中对驱动变异(p.F1461)的测试表明,基因中的rv与PD之间没有关联。

结论:我们确认具体EIF4G1变异p.R1205H似乎是一个很强的PD危险因素,但在至少一位86岁的老人中没有渗透性。两个基因中的其他一些选择rv不能被排除为因果关系。然而,没有证据表明遗传变异对糖尿病的总体贡献VPS35或EIF4G1到我们数据集的PD开发。

术语表

阳极氧化铝=
发病年龄;
EIF4G1 =
真核翻译起始因子4 γ 1;
电动汽车=
Exome变体服务器;
ICD=
内部控制数据库;
nsRV=
非同义稀有变体;
PD=
帕金森病;
房车=
罕见的变异;
纸牌游戏=
序列核关联检验;
单核苷酸多态性=
单核苷酸多态性;
深水救生艇=
同义稀有变体;
VPS35 =
液泡蛋白分选;
韦斯=
全外显子组测序

脚注

  • 去半岛投注体育官网Neurology.org全面披露。作者认为相关的资金信息和披露,如果有的话,将在本文的末尾提供。

  • 编辑、页面974

  • 收到了2012年7月9日。
  • 接受2012年10月8日。
  • ©2013美国神经病学学会半岛投注体育官网
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